自高台黑河湿地国家级自然保护区管理局成立以来，认真开展湿地资源和生态监测，逐步掌握保护区动植物资源分布状况，利用山水林田湖草等生态恢复项目，积极实施湿地保护区生态恢复工程，切实改善保护区生态环境。加强生物多样性保护，在湿地保护区开展植被恢复、围栏禁牧、湿地生态补水等保护项目，强化落实保护区巡查管护措施，在候鸟重点栖息、繁殖区域设置大幅鸟类保护宣传牌，利用“世界湿地日”、“世界环境日”、乡镇群众赶集等活动，散发湿地保护宣传单、播放湿地保护法规录音等方式开展宣传，全社会保护湿地资源的理念逐步增强。

通过落实各类保护措施，湿地保护区生态环境显著改善，各类植物生长茂盛，鸟类栖息繁殖环境逐步好转，生物多样性功能日趋良好，湿地保护区水清草茂、百鸟翔集，处处都是大自然美景。至5月底，监测记录湿地鸟类18目、40科、105种、约3万余只，呈逐年增加趋势。监测记录国家重点保护的裸果木、胡杨等湿地长生植物48种，保护区植物生长良好。开展湿地重点水域水量监测面积4826.6公顷，淹水面积没有明显减少和退化现象。湿地保护区水质监测标准达到《地表水环境质量标准》三类以上，没有发现水质污染情况。

经过近几年湿地保护区生态环境整改和生态修复，湿地生态环境的逐步好转，到湿地保护区栖息、繁殖的珍稀候鸟种群数量逐年增加。黑鹳、白尾海雕、金雕、大天鹅等国家Ⅰ、Ⅱ级重点保护鸟类都在湿地保护区栖息繁殖、迁徙越冬，黑鹳、白鹭、苍鹭、鸬鹚等部分候鸟已变成留鸟，这也是湿地保护区生物多样性功能明显改善和生态环境好转的重要标志。